El estandarte con el que hoy en día desfila la Hermandad de San Juan Evangelista desde 2008 está confeccionado en terciopelo verde y tiene forma de pergamino, en alusión al Cuarto Evangelio, escrito por San Juan. Su diseño es obra de Fernando Martínez García. Las piezas bordadas a mano por las monjas Clarisas de Hellín están enriquecidas con canutillos, lentejuelas, cordones y rellenos en oro entrefino. El protagonismo en este estandarte lo ostenta el símbolo de San Juan en el Tetramorfos: el Águila (por el espíritu elevado y místico) y el Libro, por sus escritos llenos del Espíritu Santo). Junto a éstos aparece nuestra tradicional palma, que en la iconografía cristiana representa el símbolo de la victoria y del triunfo de los mártires. También sigue apareciendo la Cruz de Malta, si bien como una pequeña reseña, dado que en todos los anteriores estandartes de la Hermandad viene siendo la máxima representación, aún sabiendo que la misma no está asociada a la imagen del Evangelista, sino del Bautista. Bajo ellos se encuentra el escudo de Tobarra. La parte trasera está confeccionada en raso valencia y sobre él se plasma el siguiente texto: “En el inicio existía la Palabra, y la Palabra era Dios”. El estandarte está montado sobre un varal realizado en la Fábrica de Bronces de Riópar.